Торжественную закладку храма совершили 2 сентября 1901 года по благословению епископа Рижского и Митавского Агафангела (Преображенского) священники Михаил Смирнов, Карп Тизик и Кирилл Янсон.
Храм сооружен по проекту епархиального архитектора В. И. Лунского в византийском стиле и 13 июня 1904 года освящен владыкой Агафангелом в честь Рождества Иоанна Предтечи.
Интересно, что во время бомбежек во Вторую мировую войну практически был разрушен весь город, но два храма — православный и лютеранский — не пострадали!
В 1997 году московский художник Геннадий Чумыкин расписал в храме потолок.